（接上）对于房地产开发企业，在土地增值税清算时，按照《土地增值税清算管理规程》第二十一条第一款“在土地增值税清算中，计算扣除项目金额时，其实际发生的支出应当取得但未取得合法凭据的不得扣除。开发成本的扣除均以取得合法有效的发票为前提，这是原则性问题，在政策文件中多次明确规定需取得“合法有效凭证”、“实际发生”等，这便要求不仅实际支付，且须开具合法合规发票，对已开票未支付往往是不能在清算时进行扣除的。因此，房地产开发企业在项目开发过程中，建设工程合同与结算必须合乎规范，成本发票确保合规和真实，才能在最终的土地增值税清算时成本得到扣除。
应注意到，扣留的质保金能否在土地增值税清算时扣除，关键在于是否开具了合规的发票。已开具发票的，按发票金额予以扣除；未开具发票的，即使已预留或约定，也不能在土地增值税清算中扣除。也就是说，在质保期内，无论开发商是否实际支付此笔款项，只要取得了此笔质量保证金的发票即可以扣除，至于质保期满之后如何扣除，各地税务局的执行口径也有所不同，应以当地主管税务机关的口径为准。#土地增值税清算 #财税咨询 #房地产开发
